Москва. 10 июня. ИНТЕРФАКС-СИБИРЬ - Ученые США разработали вычислительный метод, позволяющий прогнозировать симптомы и вирулентность различных патогенов, а также идентифицировали человеческие белки, на которые воздействует SARS-Cov-2, говорится в сообщении Американского химического общества.
Отмечается, что вирусные ферменты-протеазы, расщепляющие пептидную связь между аминокислотами в белках, играют важную роль в репликации вируса. В частности, для SARS-CoV-2 имеет большое значение папаиноподобная протеаза PLpro.
"Теперь исследователи обнаружили другие мишени PLpro в протеоме человека, включая белки, участвующие в сердечно-сосудистой функции, свертывании крови и воспалении, предполагая связь между инактивацией этих белков и симптомами COVID-19", - говорится в сообщении.
Вирусы, в том числе SARS-CoV-2, производят несколько белков в виде одного длинного "полипротеина", а вирусные ферменты-протеазы распознают специфические аминокислотные последовательности в этом полипротеине и разрезают его, чтобы высвободить отдельные белки.
Однако некоторые белки человека также содержат эти последовательности (известные как гомологичные последовательности хозяина-патогена или SSHHPS), включая те, которые участвуют в генерации врожденного иммунного ответа.
Исследователи разработали вычислительный метод для поиска в базе данных всех известных белков человека последовательностей, похожих или идентичных SSHHPS SARS-CoV-2.
Анализ показал, что это белки, которые имели сердечно-сосудистые, воспалительные, почечные, дыхательные или связанные с кровью функции.
Например, два из белков, содержащих SSHHPS, были сердечными миозинами, связанными с несколькими кардиомиопатиями, один был антикоагулянтом, а другой-противовоспалительным белком.
Инактивация этих белков PLpro согласуется с симптомами COVID-19 - поражением сердца, тромбами и воспалением. Команда подтвердила, что PLpro может разрезать эти белковые последовательности in vitro.
Проведение того же анализа на SSHHPS для вирусной протеазы Зика выявило белки, связанные с неврологическим развитием и нарушениями, соответствующими симптомам Зика.
"Эти результаты предполагают, что симптомы и вирулентность вирусов могут быть предсказаны непосредственно из их геномных последовательностей", - говорится в сообщении.
Большая роль протеазы PLpro отмечалась в исследованиях и ранее, ряд ученых предлагал создать противовирусные средства, основанные на блокировании этого фермента.
