Санкт-Петербург. 20 апреля. ИНТЕРФАКС СЕВЕРО-ЗАПАД - Группа ученых Санкт-Петербургского университета, Института цитологии РАН и Университета Цинхуа (КНР) начала исследовать пептид, потенциально способный заблокировать связывание нового коронавируса с клетками человека, сообщает пресс-служба российского вуза.
В СПбГУ подчеркивают, что при удачных экспериментах в будущем пептид можно будет использовать для создания лекарства от COVID-19.
Как объясняют ученые, для вторжения в клетки человеческого организма коронавирусы, в том числе и SARS-CoV-2, используют так называемые шипы. С помощью этих "шипов", образуемых на поверхности вируса специальным белком, вирус стыкуется с человеческой клеткой. Для стыковки используется один из многочисленных типов белков-рецепторов на поверхности человеческой клетки. В случае с SARS-CoV-2 это ангиотензинпревращающий фермент 2 (ACE2).
В конце марта китайские ученые опубликовали кристаллическую структуру ACE2, а исследователи из Массачусетского технологического института (США) смогли идентифицировать фрагмент ACE2, с которым связывается вирус, и сгенерировать его. Это пептид из 23 аминокислотных остатков.
По замыслу ученых и США, созданный ими пептид должен блокировать участок связывания белка-"шипа", тем самым лишая вирус возможности "стыковаться" с ACE2 и проникать в клетки человеческого организма. Авторы назвали свой пептид spike-binding peptide 1 (SBP1). Изучением данного пептида и занялись ученые СПбГУ совместно с коллегами из Цинхуа и Института цитологии РАН.
Как отмечает сотрудник кафедры биохимии СПбГУ и лаборатории биомолекулярного ЯМР Института трансляционной биомедицины СПбГУ Ольга Рогачева, перед исследовательской группой стоит задача доказать, что данный пептид связывается с нужным участком на поверхности белка и что это связывание достаточно сильное. Также пептид проверяется на способность неспецифически взаимодействовать с другими белками.
"Если пептид успешно проходит все эти тесты, мы начинаем исследования на клеточных культурах. К сожалению, сейчас из всего спектра методов нам доступно только компьютерное моделирование. Работа в лаборатории в данный момент приостановлена в связи с карантином", - отметила Рогачева.
На данном этапе исследователи запустили молекулярное моделирование связывания пептида SBP1 с белком АСЕ2 и заказали все необходимое для экспериментов "в пробирке".
Ученый отметила, что, если блокирующие свойства SBP1 подтвердятся, а также удастся доказать отсутствие неспецифического связывания пептида с другими белками, потенциально он может быть использован для создания лекарства от COVID-19.
Поскольку на начальных стадиях болезни вирус размножается в клетках дыхательной системы и в кровь не попадает, то оптимальными способами доставки SBP1, по мнению ученых, могут стать ингаляционный и интраназальный. По мнению Рогачевой, перспективы стать медикаментом у SBP1 есть, но говорить со 100-процентной уверенностью о нем как будущем лекарстве рано.
Однако, отметила исследователь, оптимизм внушают проводимые в настоящее время клинические исследования рекомбинантной немембранной формы ACE2 для лечения COVID-19.
"SBP1, по данным его создателей, лишь немногим уступает ACE2 в связывании белка-"шипа". В то же время, в отличие от ACE2, он не должен участвовать ни в каких процессах в организме человека. В идеале, если все это подтвердится, у SBP1 есть шансы дойти до клинических исследований в качестве недорогого и безопасного лекарства, активного по отношению ко всем коронавирусам, использующим для входа в клетку ACE2", - заключила ученый.